假設(shè)父提供生父基因成為孩子生父的可能性和隨機(jī)男人提供生父基因成為孩子生父的可能性的比值叫作親權(quán)指數(shù)（paternity index，PI）。前一種可能性假設(shè)為X；后一種可能性假設(shè)為Y。上例中的假設(shè)父2基因型為24/25雜合子，他提供生父基因FGA-25的可能性為1/2，即X=1/2。隨機(jī)男人提供生父基因FGA-25的機(jī)會(huì)為該基因的頻率，即Y=0.0958。因此，此例的PI值為0.5/0.0958=5.22。如果假設(shè)父2的確是孩子的生父，則不論檢測(cè)多少位點(diǎn)，均不會(huì)排除他與孩子的親生關(guān)系，在所有檢測(cè)的位點(diǎn)，每一個(gè)位點(diǎn)就可以計(jì)算出一個(gè)PI值，多個(gè)位點(diǎn)的累計(jì)PI值等于各個(gè)位點(diǎn)PI值的乘積，但前提條件是所檢測(cè)的各位點(diǎn)之間沒有遺傳連鎖關(guān)系。

三聯(lián)體基因型組合的可歸納為三條原則：

（1）當(dāng)假設(shè)父為純合子時(shí)，X=1；假設(shè)父為雜合子時(shí)，X=1/2，但雜合子假設(shè)父的2個(gè)基因均可能是生父基因時(shí)，X=1。

（2）只涉及1個(gè)生父基因時(shí)，Y值等于生父基因的頻率。

（3）若涉及2個(gè)生父基因時(shí)，Y值為2個(gè)生父基因頻率之和。